显微镜下金葡菌基因组DNA提取的技巧
一、组织抽提:
1. 显微镜下取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末
2. 移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打
3. 移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆
4. 冰上孵育5分钟
5. 离心12,000g 4℃ 5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管
6. 加0.2 ml氯仿,震荡,冰上孵育5分钟
7. 离心<12,000g 4℃ 10分钟 取上层液相移入1.5ml新离心管
8. 加0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟
9. 离心<12,000g 4℃ 5分钟 弃去上清液
10. 加入1 ml 75%乙醇,震荡
11. 离心<7,500g 4℃ 5分钟 弃去上清液
12. 室温下使之变透明
13. 加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA( 可保存在液氮或低温冰箱)
14. 走RNA变性电泳观察18s,28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度
二、RT反应体系(第一步):约20分钟
RNA 抽提物
5μl
Radome 引物
2μl
RNA sin
0.5μl
1. 65℃ 15分钟
2. 立即放入冰浴
RT反应体系(第二步):约2小时
RNA sin
0.5μl
10mM dNTP
1μl
5×RT 缓冲液
4μl
25mM MgCl2
4μl
AMV 逆转录酶
3μl
1. 37℃ 1.5小时
2. 94℃ 5-10分钟
3. 反应物保存于-20℃或进行PCR
三1、PCR反应体系:约4.5小时
25mM MgCl2
2μl
10×PCR 缓冲液
5μl
10mM dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
2.5μl
ddH2O
34μl
Taq酶
0.5μl
轻质石蜡油
50μl
100μl
1. 94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环
2. 94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步30个循环
3. 72℃ 10分钟
4. 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳
三2、PCR反应体系:约5小时
25mM MgCl2
3μl
10×PCR 缓冲液
5μl
10mM dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
5μl
ddH2O
30μl
Taq酶
1μl
轻质石蜡油
50μl
100μl
1. 94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环
2. 94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步40个循环
3. 72℃ 10分钟
4. 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳
四、电泳:约1.25小时
1. 配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml
2. 胶浓度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g胶)
3. 微波炉中火2分钟溶解胶
4. 冷却至60℃加入溴乙锭2μl(10mg/ml的终浓度0.5μg/ml)
5. 放入梳子,浇板,待凝固
6. 加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰
7. 电泳50-80V(每㎝ 5V)
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