显微镜下真菌和细菌的形态差别还是很明显的，细菌一般都要经过染色之后才能观察。而真菌个体要大些，产孢结构明显，孢子链形态多样，有串生、簇生、帚状枝等等，所以一般都能够直接观察。

 

如果要更细致的观察我们就要：

 

    因为实验室一般常用普通的光学显微镜。但是由于细菌体积小且透明，活体细胞内含有大量水分，因此，对光线的反射与吸收差别不大。当把细菌悬浮在水滴内，放在显微镜下观察时，由于与周围背景没有显著的明暗差，难以看清他们的形状，更谈不上其细微结构。经过染色，就可借助颜色的反衬作用比较清楚地观察微生物的形状和结构，亦即菌体表面及内部结构着色与背景成鲜明对比，这样便可在普通光学显微镜观察形态和结构，而且还可以通过不同染色反应来区别微生物类型以及死.活细菌。
因此，必须用染色的方法来区别。

 

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