甲醇对眼睛的毒性早在二十世纪初就已经被发现,其可造成失明的严重后遗症。甲醇的眼睛毒性作用主要发生在视神经节细胞及神经髓鞘,因为代谢物甲酸的累积,抑制了细胞粒线体的细胞色素氧化酶(cytochrome oxidase)功能,而损伤细胞;临床上可出现视觉上的闪光、模糊、色觉异常、甚至发生视野缩小、盲点(scotoma)、甚至视觉丧失的现象,眼睛检查可以发现瞳孔扩张、瞳孔反射异常,以及急性期的视神经盘充血及水肿,较终则出现视神经盘萎缩的病灶;视网膜本身一般并无异常特征。
甲醇中毒,除非能及早有所怀疑,否则并不容易被诊断出,立即的治疗主要在于矫正代谢性酸中毒、维持生命征象(vital signs)、减缓及移除甲醇及其代谢等方式(包括使用fomepizole、ethanol、及血液透析等),即便如此仍然可能留下视觉丧失的后遗症,因此为眼科的急症。
人工糖精阿斯巴甜(aspartame),商品名包括NutraSweet、Equal、及Canderel等,近年来就被部分人士(Betty Martini's conspiracy theory)诟病,在体内可被代谢成为甲醇及其他物质,因此对身体可能会造成许多伤害(甚至癌症),而发起反糖精运动;不过目前科学界仍普遍认为在一般剂量下,糖精是安全无虞的。