1. 真菌生命週期主要阶段是单倍体，生活环境潮湿多水分，这几点十分接近藻类，它们可能是在古代地球水分非常多、空气十分潮湿的时期演化出来并且大量繁衍的物种。
2. 真菌的繁殖方式包含有性生殖与无性生殖，古代的藻类也是如此，这是古生物的共同特征。
3. 真菌有三种无性生殖：块裂繁殖、出芽繁殖(budding)、长出孢子spores。真菌的有性生殖，2种菌丝相接融合成双倍体的接合子。
4. 地球上所有生物的生命目的是延续族群的生存权，因此，捕捉食物、繁殖方式是分类的重要标準。
5. “有性生殖组织是分类的基础。”因为有性生殖更複杂，是经历更长久的演化而产生的特征。不同的族群绝对无法共同生育下一代，因此从有性生殖也可以断定哪些是独立的族群、哪些是互为近亲的族群。
6. 但是，目前所知道的“不完全菌”缺乏有性生殖，只有无性生殖；这可能是因为它们比较原始，尚未进入有性生殖阶段，如果“不完全菌”确实只有无性生殖，那么，不完全菌可能比“像植物的原生生物—藻类”更原始，接近“真细菌”。
7. “大部分真细菌繁殖透过“二分裂binary fission”无性生殖，这种细胞分裂会产生二个一模一样的子代细胞，没有透过有丝分裂（没有出现纺锤丝，直接複制基因）。”这种繁殖有点类似真菌的出芽生殖的模式。
8. “有些种类的细菌会用接合conjugation繁殖；发生接合的时候，二个真细菌彼此会非常靠近，彼此之间会出现连接细胞质的管线，细菌部分的染色体或细胞质，透过连接管线传送到对方那裏。”这有一点像真菌利用菌丝护送细胞核的模式。
9. 这些相似处，并不是说真细菌与真菌是同一个物种，因为真细菌是没有细胞核的，而真菌演化出细胞核（真核），从结构来看是截然不同的物种。
10. 但是，繁殖轨迹强烈显示真细菌与真菌在地球生态社群中同一个位阶的有机体，很可能是同一个古地球时期诞生的物种，所以繁殖的原始程度类似。
11. 真细菌与真菌能制造许多种抗生素，抗生素较原始的功能并不是替人类治病，应该是为了抑制或消灭敌人，这显示真细菌与真菌视对方为生存敌手，互相竞争食物与空间，才演化出这种特征。
12. 真菌与真细菌在生态环境的食物链上，都扮演分解者角色，这也可能是它们很容易短兵相接的原因。大部分的真细菌是需要吸取养分的异营生物，若不是寄生在腐败生物体上，就是寄生在活体上。真菌也是如此。
