显微镜直接测数法-土壤中微生物的分布状况
土壤微生物学
土壤微生物学的主要对象或因子，是土壤环境（即条件因子或环境因子）下能活之微生物。站在微生物学之立场，土壤微生物学是研究各种土壤微生物，类似微生物学的各论及生态学；而站在土壤学之立场，土壤微生物学是多种微生物生长于混合固体基质（即土壤），似一种生化反应器（土壤环境）内固体酦酵之研究。
研究土壤微生物学的方法可归纳如下：
一、一般土壤中微生物之分布状况瞭解：通常可由显微镜直接测数法、玻片埋土法、培养法、测微生物特定成分或测其产物（例如土壤酵素、土壤呼吸力）等来探讨。
二、特定微生物：有关特定微生物，可用强化培养法（Enrichment Culture）来分离及测定其数与活性。
三、土壤基质性质之探讨：例如土壤保水力（Water Holding Capacity 即WHC）与土壤水分之比例，决定土壤好气或嫌气情况、溶解性养分量及适当湿度环境，而影响了微生物之分佈与数量。
首先考虑条件因子中土壤基质（包括土壤物理、化学性质、栽培作物等）对微生物之影响：土壤物理性质有：土壤之质地、构造、空气、水分、温度、颜色等；土壤化学有：土壤胶体、PH（土壤反应）、酸度、盐度、碱度，以及氮、磷、钾与微量元素等。上述土壤物理、化学性质对微生物之影响，可举一例说明之。当土壤水分达保水力的三分之二至二分之一时，土壤通气良好，适合大部分微生物生长。又如浸水土壤中嫌气性硫酸还原菌、乾旱土壤中真菌、放线菌活动较多。作物为土壤环境因子之一，对微生物具有甚大的影响，所以根圈土壤含有较多之胺基酸，而普通土壤有较多的维生素，所以根圈土壤之微生物相是特别的。荳科植物有根瘤，而所谓可节省氮肥的肥料木（如赤杨木）之根也有根瘤，但其并不是根瘤菌（Rhizobium），而是其他微生物。真菌寄生的树根称为菌根（Mycorrhiza），在此有共生作用。气候条件也是土壤环境条件之一，例如水田含有光合作用的蓝绿藻，在阴光下滞留的土壤水中，含有Rhodopseudo Monas类之光合细菌。
其次考虑土壤微生物活动对土壤肥力之影响：此部分范围甚广，如碳、氮、磷、铁等循环，以及其他矿物元素之转变、腐植质之生成、固氮作用、脱氮作用、硝化作用、溶解化作用。例如异营性微生物为碳循环中的主要分解者，光合成微生物可增加土壤有机物及肥力，在好气环境下Azotobacter、Spirillum、Rhizobium等可固定空气中之氮，而增加土壤氮素，在水田嫌气环境下, Clostridium也可进行固氮作用，但很慢。连作时，根圈附近强化（Enrich）了病害菌，使病害菌聚积，对作物产生病害。
