菌种细菌分类特征检测微生物图像显微镜厂商
对于许多细菌菌株，科学家能鉴定出它们所属的种。而还有一些细
菌菌株，很难判断它们是否归属于已有的菌种，或足以被定义为新
种。近年来，生物间的蛋白质和DNA相似度被证明是解决以上问题
的可靠方法。
奇怪的是，将细菌所在的属再归类到更高的分类等级——科、
目、纲和门比确定属中的种和菌株要难得多。许多肉眼可见的生物
，可以从化石记录中确定它们与其他生物的进化关系，从而进行分
类。人们也曾尝试通过进化关系来进行细菌分类，但是由于化石记
载的不完整和信息有限，这种努力未获成功。即使有一份完整的化
石记载，但也只能提供形态学方面的信息，不足以确定其进化关系
细菌分类的相关问题
尽管人们在细菌分类方面已做出了极大的努力，但细菌学家对
细菌分类学的看法如下：那些自上而下的分类方式至少能对原核生
物提出比较合理的划分；提倡从底层向上进行分类的细菌学家能明
确菌株、种、属，有时还能将细菌归类到更高层类群。
随着全基因组测序工作的进展以及越来越多横向基因传递实例
的发现，细菌分类面临的困难大大加剧了。虽然对少数细菌所属的
科、目和纲能被清楚地界定，但对大多数的细菌来说，可用的分类
信息实在太少了。
