在光学显微镜观察下鉴定和计量地球微生物
地球微生物学非分子学方法
地质微生物活动可以进行现场研究，也可以在实验室作为系统
或离体反应进行研究。一种地球微生物现象的现场研究应包括鉴定
和计量地球微生物的活性物质，并在现场环境中测定它们的平均生
长速率，还包括反应中问产物(包括不溶的矿物颗粒和可溶的有机
或无机底物)物理和化学鉴定底物，还包括测定总的反应速率，评
估不同的环境因素对反应速率的影响。然而实际上，有的可能在较
早的地质时期发生过的地质微生物过程在现有环境条件不会再发生
了。在这种情况下，这些过程中微生物的作用需在显微镜观察下重
建(例如，寻找与起始物有关微生物化石，尤其是找到过程中反应
产物的微生物化石)也可以改为地质化学法观察，比如在沉积的岩
石样品中寻找标志化合物。这种岩石样品可以表明过去存在与生物
标志化合物相关的一种微生物或一群微生物。如果可行，寻找一种
涉及地球微生物过程关键因子的同位素也是非常重要的。
考察一个正在进行的地球微生物过程需研究其所在的自然环境
，在陆地环境中包括研究岩石、土壤或泥沙的质地、矿物质成分、
当时的温度、pH、氧化还原电位(Eh)、光照强度、季节循环、可利
用的水分、氧气或其他终电子受体和养分。在水环境中，包括研究
水深度、可利用的氧气或其他终电子受体、浑浊度、透光条件、热
力分层、pH、Eh、水中化学物质成分，还需要考虑沉降层的性质包
括产地、养分资源和可获得性等。
