矿体中硫化铁和其他金属硫化物分析图像显微镜
在矿体里保存的作用。这种作用看起来好像是由先前矿井的内部和
外部环境条件造成的。这或许不总是嗜酸氧化亚铁硫杆菌的作用。
当矿体中硫化铁和其他金属硫化物首先在采矿过程中开始氧化暴露
在空气和水中。改变是不是在煤矿中AMD的形成过程中也有发生。
金属硫化物局部是高度浓缩的，在这种情况下，它们组成了原矿石
。虽然大部分不含铁的金属硫化物是由岩浆和热液参与的非生物过程，
但是一部分沉积物是生物合成的。在这些硫化物沉淀物合成过程中，通
常是源于细菌还原的硫酸，但是一些特殊情况下，可能是源自有机含硫
化合物的矿化。因为金属硫化物是相对不溶的，因此金属离子和生物合
成的硫化物的自发反应是很容易进行的。一些特殊的金属硫化物矿物已
经在实验室里进行了生物合成。这些实验都需要相对不溶的金属化合物
作起始反应物，以此来消除金属离子对硫酸还原细菌的毒性。在自然界
里，一些沉积化合物对金属离子的吸附起到了相似的作用。降低金属离
子浓度以此来削弱它对硫酸还原细菌的毒性。
金属硫化物也受到了一些细菌的氧化，如Th嗜酸氧化亚铁硫杆菌，
氧化亚铁钩端螺旋菌，超嗜热古菌，极度嗜热菌，以及一些其他的细菌
。这些细菌可以直接氧化，通过破坏金属硫化物晶格来进行反应，或者
是通过间接氧化过程，通过生成过滤剂(酸性硫酸铁)，过滤剂再通过化
学过程氧化金属硫化物，间接氧化机制在溶解铀矿中是非常重要的一个
过程。微生物氧化金属硫化物已在工业上被开发应用。用来从低级金属
硫化矿和含沥青铀矿中提取有价值的金属，并且这种机理在高级矿和富
集矿中已被检测到。在含沥青的煤矿中，由于矿化的活性，这个过程看
起来是暴露的，硫化铁由这些细菌的氧化在工业上是有毒的过程，是因
为有害的酸性矿山废水的存在。
